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Jan 10, 2024

Scientific Reports 13권, 기사 번호: 8972(2023) 이 기사 인용

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측정항목 세부정보

단백질의 아세틸화, 탈유비퀴틴화 및 인산화와 같은 번역 후 변형(PTM)은 다양한 종류의 암 진행에서 중요한 역할을 합니다. 고정되지 않은 폴리유비퀴틴을 특이적으로 인식하는 유비퀴틴 제거 효소(DUB)의 독특한 구성원인 유비퀴틴 특이적 단백질분해효소 5(USP5)는 많은 종양 형성 관련 단백질의 안정성을 조절하여 암의 시작과 진행에 영향을 미칠 수 있습니다. 그러나 범암에서 USP5의 다양한 생물학적 중요성은 체계적이고 종합적으로 연구되지 않았습니다. 여기서는 The Cancer Genome Atlas(TCGA) 및 Genotype-Tissue Expression(GTEx) 데이터베이스를 사용하여 범암에서 USP5의 역할을 탐색하고 R, GEPIA2.0 등 다양한 소프트웨어 및 웹 플랫폼을 통해 데이터를 수집하고 분석했습니다. , HPA, TISIDB, cBioPortal, UALCAN, TIMER 2.0, CancerSEA 및 BioGRID. USP5 발현은 대부분의 암에서 높았으며 암의 다양한 분자 및 면역 하위 유형에서 크게 달랐습니다. 또한 USP5는 여러 암에서 특정 진단 가치를 갖고 있으며 USP5의 높은 발현은 일반적으로 암 환자의 예후가 좋지 않을 것으로 예측했습니다. 또한 USP5의 가장 빈번한 유전적 변형 유형은 돌연변이였으며, USP5의 DNA 메틸화 수준은 다양한 암에서 감소하는 것으로 나타났습니다. 또한, USP5 발현은 암 관련 섬유아세포(CAF), 내피 세포(EC) 및 암의 면역 조절제의 유전적 마커와 상관관계가 있었습니다. 더욱이, 단일 세포 시퀀싱 결과는 USP5가 세포사멸, DNA 손상 및 전이와 같은 여러 가지 종양 생물학적 행동을 조절할 수 있음을 보여주었습니다. 유전자 농축 분석에 따르면 "스플라이스솜"과 "RNA 스플라이싱"은 USP5가 암에 관여하는 중요한 메커니즘일 수 있습니다. 종합적으로 말하자면, 우리의 연구는 인간 범암의 진단, 예후 및 면역에 있어 USP5의 생물학적 중요성을 밝혀줍니다.

암은 인간 사망의 주요 원인으로, 전 세계적으로 사회 건강과 경제에 심각한 부정적인 영향을 미칩니다1,2. 수술, 화학방사선요법, 표적치료제, 면역요법 등의 발달로 암에 대한 치료 효과가 향상되었음에도 불구하고, 암 환자의 예후와 생존율은 약물 내성, 부작용 등 여러 이유로 여전히 열악한 상태로 남아 있습니다3. 따라서 새로운 범암 바이오마커와 암 치료 표적의 발굴은 인류 건강 증진에 매우 중요합니다.

Deubiquitination은 신호 전달 및 암 진행과 같은 다양한 생리적 기능 및 병리학적 과정을 조절하는 데 관여하는 단백질의 일반적인 번역 후 변형(PTM)입니다. Wilkinson 등이 발견하고 정제한 유비퀴틴 이소펩티다제 T(ISOT)로도 알려진 유비퀴틴 특이적 단백질분해효소 5(USP5)는 탈유비퀴틴화 효소(DUB)의 가장 큰 계열인 유비퀴틴 특이적 단백질분해효소(USP) 계열에 속합니다. 7. USP5는 인간 염색체 12p13의 CD4 유전자 근처에 위치하며 크기가 93.3-kDa8인 5개의 별도 도메인을 암호화합니다. 이는 고정되지 않은 폴리유비퀴틴 사슬9의 근위 말단에서 유비퀴틴을 구체적으로 식별하고 제거할 수 있다는 점에서 독특합니다. 그리고 많은 연구를 통해 USP5가 DNA 이중 가닥 파손 복구10, 염증 반응11, 스트레스 반응12 등 다양한 세포 활동을 조절한다는 사실이 입증되었습니다.

암에서 USP5의 역할에 관해서는 최근 많은 연구자들의 관심을 끌고 있습니다. 비정상적인 USP5 발현과 유방암13, 폐암14,15, 대장암16 및 간세포암종17과 같은 다양한 암의 발생 사이의 기능적 연관성은 많은 연구를 통해 확립되었습니다. 한편, USP5는 암을 조절하는 일부 주요 분자 및 경로와 밀접한 상관관계가 있는 것으로 입증되었으며, 이는 USP5가 암에 대한 새로운 치료 표적으로 잠재적인 가치가 있음을 나타냅니다18. 그러나 범암에서 USP5의 상세한 역할은 아직까지 파악하기 어렵습니다.

 0.7) in 20 cancer types, including ACC, BRCA, CESC, CHOL, COAD, DLBC, GBM, HNSC, KIRP, LGG, LIHC, LUAD, LUSC, OV, PAAD, READ, STAD, TGCT, THYM and UCS (Fig. 6A–T). Among them, USP5 had great diagnostic performance (the area under the curve > 0.9) in BRCA, CHOL, DLBC, LGG, LUSC, PAAD and THYM./p> 0.7) in 20 cancer types, especially in predicting BRCA, CHOL, DLBC, LGG, LUSC, PAAD and THYM (AUC > 0.9), indicating the potential clinical application value of USP5 as a reliable diagnostic biomarker. Meanwhile, as a unique member of deubiquitinating enzymes (DUBs), USP5 could manage the stability of some key tumor-regulating proteins such as, Hypoxia-inducible factor 2α (HIF2α) in BRCA13, CyclinD1 (CCND1) in GBM22, Snail Family Transcriptional Repressor 2 (SNAI2) in LIHC17, Histone Deacetylase 2 (HDAC2) in OV23, Signal Transducer And Activator Of Transcription 3 (STAT3)20, WT1 Transcription Factor (WT1)21 and Forkhead Box M1 (FOXM1)24 in PAAD and Catenin Beta 1 (CTNNB1)25, Programmed cell death ligand 1 (PD-L1)26 and CyclinD1 (CCND1)15 in NSCLC to promote cancer progression, and our receiver operator characteristic (ROC) curve analysis showed the area under the curve (AUC) of 0.905 in BRCA, 0.852 in GBM, 0.891 in LIHC, 0.820 in OV, 0.980 in PAAD and 0.946 in LUSC. Thus, the combination of USP5 with these tumor-related biomarkers separately may significantly improve the diagnostic accuracy for the above cancers. Using cox proportional hazards model and Kaplan–Meier analysis, we found that USP5 was negatively correlated with patients’ prognosis generally. Specifically, USP5 expression indicated poor overall survival in patients with LAML, LIHC, LUAD, MESO, SKCM and UVM. In addition, we further analyzed the association between the expression level of USP5 and disease-specific survival or progress-free interval of cancer patients, and we proved that on the whole, USP5 exhibited risk role in MESO and UVM for overall survival, disease-specific survival and progress-free interval, in LUAD and SKCM for overall survival and disease-specific survival and in COAD for disease-specific survival and progress-free interval. In addition to the previous reported negative association between USP5 and the progression of BRCA13, BLCA27, CRC16, GBM22, LIHC17, melanoma28, NSCLC15,26, OV23 and PAAD20, our result first showed that USP5 may emerge as a novel biomarker for predicting the prognosis of ACC, LAML and MESO, especially MESO. These results suggested that USP5 had important diagnostic and prognostic implications in various cancers, and may serve as a therapeutic target for precision oncology./p>